基因諾亞方舟：測序物種增至6.6萬個

一個由50 個機構聯手的國際 財團組建的基因諾亞方舟項目近期 宣布，將蒐集物種的數量從原先目 標的1 萬增至6.6 萬個。獲得基因 序列將保存在開放的網絡平臺上供 人類共享。

科技博客Gizmodo 報導， G10K 財團組織的基因諾亞方舟項 目——脊椎基因工程（VGP），預 計投資6 億美元蒐集地球上6.6 萬 個脊椎動物品種的基因序列，包括所有哺乳動物、鳥類、爬行動物、 兩棲動物和魚類。來自12 個國家 50 個機構的150 多位專業人員參 與這一項目。

該項目原計畫蒐集至少1 萬個 脊椎動物品種的基因序列，但隨著 基因序列技術的極大發展和成本的 降低，G10K 決定將蒐集的品種增 至6.6 萬，而且每個品種還分別蒐 集雌雄兩個個體的樣本。

G10K 財團上週在紐約洛克菲 勒大學（Rockefeller University） 舉行的2018 基因組10K 大會上宣 布了項目的擴容。

會上還展示了代表著五大類脊 椎動物的14 個新蒐集的高質量基 因序列，包括大馬蹄蝙蝠、加拿大 山貓、鴨嘴獸、安娜蜂鳥、鴞鸚鵡 （新西蘭一種不會飛的鸚鵡，大約 僅存150 隻）、沙漠龜、雙紋蚓螈 （一種奇怪的無肢兩棲動物，長得 像蛇）和攀鱸等。

G10K 聯合創辦人之一、聖地 亞哥動物園保護研究所的Oliver Ryer 說，這個項目將幫助科學家 了解物種滅絕、惡性突變、近親繁 殖、遺傳瓶頸等問題的原因。

十年前G10K 啟動之時，其成 員完全不知道獲得高質量的基因序 列做科研之用需要多長時間和多少 開支。然而現在他們能夠：

● 著重使用長讀、非短讀測序 來獲得高質量基因組。意即讓每個 基因數據塊長一些，這樣只需數千 個數據片段拼成一個基因組；若是 短讀測序，則需要數百萬個數據片 段。

● 不再把雌雄序列混合稱一個 基因組，而是給雌雄體分別測序。 馬克斯普朗克分子細胞生物 學和遺傳學研究所（Max Planck Institute of Molecular Cell Biology and Genetics）的領銜研 究員、VGP 項目成員之一Gene Myers 說，十年後的今天，平均 每個脊椎物種測序只需不到一千美 元，按照這個趨勢繼續發展，基因 組領域的格局將發生極大變化。

要知道十年前，給一個動物測 序就要數百萬美元和幾年的時間。 G10K 召集人、國家人類基 因組研究所（National Human Genome Research Institute） 的 Adam Phillippy 說， 新技術讓一 項測序可在一週內完成；新物種首 次測序耗資約三萬美元。

這個項目蒐集的所有基因序列 將存在「基因組方舟數據庫」中， 一個在線開放平臺上供科研界共 享。◇