新皇崗口岸將於2026年投入使用。深圳市口岸辦主任王剛接受大陸傳媒訪問時表示，新口岸將在「一地兩檢」的基礎上，實施「合作查驗」模式，採取「一次通關、一次查驗」，核心是深港之間要實現訊息共享及合作查驗，由原本雙方分別查驗，變為「一次過境、分別查驗、聯合檢測」的方式。他聲稱工作沒有很大變化，但可以加快通關時間。
香港保安局早前向立法會提交文件時，提到在「優化」現有邊境管制站及規劃新的邊境管制站時，會研究以實施「一地兩檢」為目標，與深圳市當局研究過關檢查模式，包括「合作查驗、一次放行」模式。文件當時僅透露，「合作查驗 、一次放行」模式是指出入境雙方的自助通道或櫃檯將在兩地口岸邊界線上並排建立，旅客只需排一次隊、查驗一次證件，便可經過出入境雙方的查驗區域並完成兩地的出入境手續。
文件提及，皇崗口岸正進行重建工程，重建後的皇崗口岸會是首個實施「合作查驗、一次放行」的粵港陸路口岸，新皇崗口岸聯檢大樓爭取於2025年底建成。
除皇崗口岸外，港深兩地政府亦正研究在沙頭角口岸重建項目，推行「合作查驗、一次放行」的查驗模式。另外，在發展港深西部鐵路和北環線支線時，當局亦會研究採用「一地兩檢」及「合作查驗、一次放行」的安排。@
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