加拿大一組科學家發明了一種小巧便攜的基因測序工具,方便研究人員帶到實驗室之外進行實地測序,比如可以隨時隨地檢測COVID19(中共病毒)基因,準確度是現有技術的一千多倍。

這份研究的作者之一加拿大英屬哥倫比亞大學(University of British Columbia)的助理教授齊爾斯(Ryan Ziels)介紹說,牛津大學附屬科技公司開發的MinION 設備,是現有比較好用的一種便攜式測序儀,但是它的出錯率在5% ~ 15% 之間,而他們的新技術出錯率只有不到0.5%。

這份1 月初發表在《自然- 方法》(NatureMethods)期刊上的研究,採用了一種條形碼系統, 使得長讀測序的準確度達到MinION 這樣系統的一千多倍。長讀測序,又稱第三代測序,可以同時測定1 萬到10萬個鹼基對之間的DNA 長序列。

這種新技術向目標分子加入條形碼標記後,再使用常規的測序流程,包括擴增、複製目標分子等方法,最後得到結果。

研究稱,使用條形碼標記的方法便於把相關的DNA 片段分組,能夠測序的最長基因片段,是現有技術可以處理的長度的10倍。較長的基因片段,有助於判斷細微的基因變異。

齊爾斯說:「這個方法的一個好處在於,它適用於任何能夠被擴增的基因。」該研究組把處理細節公佈在共享空間內,供所有研究人員使用。

「這種新方法對很多需要高準確度地測序長序列基因的領域非常有用,比如癌症研究、植物研究、人類基因和微菌科技等。」

該研究組目前正和溫哥華合作,把這種技術定製成可以隨時隨地檢測城市供水和下水道污水內微菌的工具。及時了解城市供水系統內的微菌情況,對改善城市衛生和污水處理系統具有重要作用。特別在現在應對中共病毒瘟疫的時期,是控制病毒傳播的一個有效工具。◇

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