港大委任清華黨委任副校事件引起外界極大關注。27日，任命在眾多爭議聲中、在數千師生的反對聲中仍然通過。港大11名校董在會議前發聯署公開信，指事件將無可避免引起「黨委治校」的嫌疑和憂慮，對港大的學術自由帶來非常負面的影響。港大學生會認為，結果等同宣告港大院校學術自由和自主終結。據悉，校董會議原定審議修改學院院長遴選指引，將遴選小組中的民選教師及學生代表改為由校長直接委任，但最終該議程未得到討論。學生會批評修訂指引如同「中央集權」控制大學，令班底變成自己人。亦有學者認為，如此重大改動校方應就修改作諮詢及交代。
等同宣告港大學術自由和自主終結
據悉，港大校委會27日會議上，全體校委均有出席，校委會大比數通過任命。被揭發為清華大學黨委成員的申作軍，獲出任港大副校長（研究），只有一票反對；而出任副校長（學術發展）的宮鵬則獲得一票棄權以外的全數支持。對於學院院長遴選的修訂，則因會議時間所限最終未有討論。
港大學生會會前已遞交4,200人聯署的聲明，強烈反對聘任具政治聯繫人士為副校長，指校委會若在此時委任兩名極具爭議的人選為港大副校長，等同宣告港大院校學術自由和自主之終結，要求有關人選需要作政治申報、公開遴選準則及委員會成員名單等。學生代表李梓成會後見媒體表示，對事情的結果表示遺憾，但已忠於自己，對議案投下反對票。由於保密協議，未能透露會上內容，但指完全看不到相關人選的危機應變及應對大眾的能力。並表示不同人對副校長是否有政治聯繫有不同看法。
李梓成指，在制度內外，學生和校友均已努力護校，但仍無法動搖高牆。對香港未來社會環境或院校自主感到非常憂慮。他說：「我雙眼之所以含住淚水，是因為我對這個地方愛得深沉。」
港大學生會會長葉芷琳對結果感到失望及憤怒，認為校方再一次無視學生聲音和數千人的聯署簽名，表決結果宣告學術和院校自主已經終結。葉說：「這個大學不是張翔的大學，這是屬於港大師生的大學」，並將會諮詢法律行動。
民選代表改由校長直接委任 外界認為修改令校長權力加大
據「眾新聞」報道，27日港大校委會原定討論修改學院院長遴選指引，目前至少8人的遴選小組中，將其中3名民選教師代表及1名學生民選代表改由校長直接委任。另外有別於過去一般由本科生代表出任的學生代表，一旦修訂後，學院本科生及或研究生皆可出任學生代表。
葉芷琳對「自由亞洲」表示，做法等同讓港共政權直接操控香港大學。「一直都說，香港大學最高持份者其實應該是學生，院長這個修改遴選制度，刪除學生代表，往後會否有其它大學委員會都刪減學生代表呢？我們認為很可能會發生，現在是努力令學生無法參與校政決策。」
修改遴選指引目的是令班底變成自己人
葉芷琳相信，校長張翔提出此事是希望做到中央集權。「現時有很多校政決策，一些院長都有不同聲音。但如果能夠修改遴選制度，可能他將來就能真正把整個班底變為自己人。」
香港大學新聞及傳媒研究中心副教授傅景華對「自由亞洲」指出，「過往決策過程都有員工及學生參與，但如果完全撇除這方面，影響深遠。」他認為重大改動，校方應在修改方面作諮詢及交代。
至於獲委任為副校長的申作軍，透過港大向傳媒發放書面聲明，聲稱自己並非中共黨員及清華大學工業工程系黨委。他解釋稱錯誤始於數年前接任學系系主任時，被錯誤列入黨委一員。近日經傳媒報道後，他已立即聯絡清華大學校方，並已作出修改。
網民：原來中共黨員這麼見不得光
香港網民對申作軍的解釋則完全不信：「清華這種級別的學校，會出現這樣的低級錯誤，而且還是涉及黨委？做到這個位置的官員，當然都是黨員，這是前提，所以他不是黨員的可能性幾乎為零。香港的這些大學，中共介入是正常，不介入才不正常，先從副職開始，以後變成正職，然後是改造學生會……」，「正所謂武漢肺炎都唔係（不是）出自武漢」，「中共黨員……原來咁唔見得光！（原來如此見不得光）」「突破9千萬人嘅黨員，卻無人敢認」。
亦有網民嘲笑：「主人（中共）既然養著你，為何又不准你認主人了呢？」「其實仲有分別咩（還有區別嗎）？咁緊張做乜（為何這麼緊張）？驚被制裁？？」「背棄中共？違反國安法喎。」「申副校，記得要『不要爸爸，不要媽媽，只要黨』呀！」「CCP冇（沒）可能誤列。有特殊任務，轉地下黨員呀！」@
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