因應中共肺炎（俗稱武漢肺炎、新冠肺炎）疫情全球延燒，中華民國總統蔡英文2月26日表示，為全力投入防疫工作，有關5月20日的總統就職活動暫停籌辦工作，保持最大彈性因應疫情變化。
蔡英文26日在臉書表示，為了全力投入防疫工作，有關5月的總統就職活動，她做出以下三點決定：1. 暫停籌辦工作，保持最大彈性因應疫情變化。2. 防疫優先，只要疫情仍有疑慮，520就職將不會舉辦大型群眾活動。3. 一切配合中央流行疫情指揮中心的專業意見辦理。
蔡英文：防疫優先 暫停籌辦520總統就職活動
另外，她說，也要謝謝台灣信仰的團體，因為擔心信眾的聚集造成防疫的風險，陸續宣佈暫停、延後大型活動，或改以線上法會等其它方式取代。在這個關鍵時刻，她要謝謝各方信眾的體諒。
蔡英文表示，大家的慈悲心，讓防疫工作可以更加順利，也減輕了第一線醫護及防檢疫人員的壓力。國泰民安，是所有人共同的盼望。「全民投入防疫，以及宗教信仰倡導的正面力量，我們一定可以一起克服考驗」。
中華民國立法院會25日三讀通過「嚴重特殊傳染性肺炎防治及紓困振興特別條例」，規定經費上限為新台幣600億元，而經衛生機關認定須隔離或檢疫者等，得申請「防疫補償」。
對此，蔡英文在臉書表示，25日立法院三讀通過「嚴重特殊傳染性肺炎防治及紓困振興特別條例」，她要謝謝朝野政黨的合作，在最短的時間內，通過這個特別條例。在面對疫情的威脅時，朝野共同展現出台灣民主的效率。她說，「稍早法案完成三讀後，我們立即安排簽署，讓防疫和紓困工作，可以在更周全的法律基礎上，更紮實、更穩健地進行」。
「這幾天疫情在亞洲、歐洲好幾個國家快速蔓延」。蔡英文說，在這個關鍵的時刻，謝謝蘇貞昌院長領導行政院，迅速檢討法規和預算編列，針對防疫上有必要性、迫切性的地方，提出了特別條例的草案。
蔡英文表示，她也特別謝謝游錫堃院長，這是他就任立法院長後，通過的第一個法案。在他的折衝協調下，朝野各黨團攜手努力，最後終於順利通過這部特別條例。她要對兩位院長，以及朝野黨團，表示最大的謝意。
蔡英文說，她相信透過防疫特別條例的立法，從行政院到立法院，從執政黨到在野黨，「我們都有一個共同的目標，那就是儘全力防堵疫情，超前部署，務必要確保國人的健康跟安全，也要確保產業經濟的穩健」。她表示，雖然挑戰是一波接著一波，不過只要大家團結在一起，只要政府和民間共同努力，台灣一定可以通過考驗。＃
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