最新醫學研究證實，嬰幼兒時期使用抗生素會對人的終身健康造成不良影響，容易得肥胖、過敏、糖尿病及消化系統炎症性疾病。
據科技網站石英（Quartz）報道，紐約大學朗格尼醫學中心（NYU Langone Medical Center）和哈佛-麻省理工博德研究所（Broad Institute of MIT and Harvard）的醫學家指出，自然產及母乳餵養會讓孩子的胃腸道微生物群系（microbiome）健康發展。但是，抗生素會破壞嬰幼兒體內的這種良好自然狀態，改變身體的代謝狀態，易導致在日後患肥胖、過敏、糖尿病及消化系統炎症性疾病。
哈佛-麻省理工博德研究所的微生物學家蘭尼克‧艾克斯威（Ramnik Xavier）說：「給孩子們不必要的抗生素，會降低微生物群的穩定性、多樣性及豐富程度。」
艾克斯威觀察到，在孩子得一般的感冒等疾病時，給他們幾輪藥物治療後，他們腸道內的微生物菌群量出現意料之中的減少。而意想不到的是，微生物群在數量減少時，立即出現耐抗生素的菌群。雖然這些耐藥菌群一開始對人體無害，但在發生新炎症時，會給治療造成更大的麻煩。
艾克斯威進一步解釋，有時抗生素是治療疾病所必須的。問題是，大部份情況下，孩子患病屬於感冒之類的普通傳染病，都是由病毒引起的，使用抗生素不僅根本不會有療效，反而起著減低正常身體所需的免疫力、破壞腸道微生物群及產生耐藥菌的副作用。
美國科學與大眾協會（Society for Science & the Public）曾於2015年7月31日報道，紐約大學的微生物學家及內科醫生布萊瑟（Blaser）說：「十年前，我想到一個問題：『如果那些農場主在使用抗生素改變那些動物的發育情況，那麼我們對自己的孩子做了甚麼？』」
布萊瑟醫生指出，在孩子很小時就開始使用抗生素，會對孩子產生嚴重影響，會導致胃腸細菌分佈紊亂，並且永久改變身體代謝的狀態。
布萊瑟醫生表示，人們一直在使用抗生素，彷彿抗生素沒有生物成本似的。在美國，每個孩子在10歲之前平均接受了10次抗生素治療。
布萊瑟認為，只有在醫生認為是「必要」的情況下，人們才可使用抗生素。他建議人們平時不要使用抗菌肥皂和洗手液。◇
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