愛滋病毒感染有2個需要注意的問題，就是「潛伏期」與「空窗期」。
潛伏期是指，感染愛滋病毒後到「發病」的這段時間。典型愛滋病的潛伏期，從感染到發展成為愛滋病人，快者半年至5年，慢者7年至10年或更久。如果使用藥物控制治療，可以延緩發病，延長潛伏期。
空窗期是指「感染愛滋病毒後，到可以被『檢查出來』的時間」。在得到愛滋病感染的初期，可能檢驗不出來病人已經得了愛滋病毒，這就是所謂的「空窗期」。當被愛滋病毒感染後，人體不會立即產生抗體，因此以一般的抗體檢測，大約要6～12周後才能被檢查出來。
空窗期時，病人感染者體內的愛滋病毒數量多，傳染力強，可以傳染愛滋病給其他的人。
有哪些方法可以知道是不是感染了愛滋病？就目前的篩檢方法主要有下列這幾種。不過，不同的篩檢方法有不同的空窗期，也是需要被重視的。
唾液篩檢
利用唾液進行愛滋病毒抗體的檢驗。「愛滋病毒唾液篩檢試劑」的準確率高達99%。透過採檢刮板在口腔牙齦輕刮的方式取得檢體，約20至30分鐘即可判讀結果，既簡便又快速。
缺點：唾液檢驗試劑仍有空窗期的限制，這段期間無法檢測到愛滋抗體，檢驗結果僅能代表3個月前有無感染的情形。
血液篩檢
以抽血的方式進行篩檢和診斷，目的在檢驗血液中是否有愛滋病毒抗體。為避開空窗期，因此，建議在有染之虞的行為後6～12周檢測，準確度很高。
PCR
另外我們也可以使用PCR偵測病毒的量。PCR是polymerase chain reaction的縮寫，中文翻譯名稱是聚合連鎖反應。換言之，就是利用基因片段放大的技術偵測病毒的量。但由於PCR非常敏感，因此造成準確度下降，同時也不被認為是好的愛滋病毒檢測方法，建議還是在空窗期過後重複檢驗，以保心安。此方法的空窗期約7至14天，一般建議為28天。但是費用較為昂貴。
偵測病毒抗原
在愛滋病毒感染後，人體不會立即產生抗體，因此以一般的抗體檢測，大約要6～12周後才能被檢查出來，若以偵測愛滋病毒抗原之檢驗方式，可縮短空窗期，並提高愛滋病毒感染早期發現的機會。偵測病毒抗原目前有2種主要的方法：
1.愛滋抗原/抗體複合型檢測（HIV antibody and antigen combination assay）篩檢（第四代EIA），能大幅縮短空窗期至1到2星期。
2.分子生物學核酸檢測 （Nucleic Acid Testing，NAT）。核酸擴增檢測法NAT（Nucleic acid amplification technology），此一技術的靈敏度高，專一性高，直接針對血液中愛滋病毒的RNA放大並加以偵測。可在人體尚未產生抗原/抗體前，就先偵測病毒核酸，比較酵素免疫分析法可縮短檢驗的空窗期。文獻指出，NAT檢驗HIV空窗期可由22天縮短至11天。◇
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