日本腦炎是腦部的一種感染性疾病，由日本腦炎病毒引起。日本腦炎病毒感染大部份都沒有甚麼症狀，或少有症狀，但有時會產生發炎的症狀，這些症狀包括頭痛、嘔吐、發燒、意識不清、癲癇。通常症狀在感染後5～15天發生。
日本腦炎病毒通常由蚊子傳染，尤其是庫蚊，豬和野鳥可以成為宿主，疾病通常在都市以外發生，診斷由血液或腦脊髓液檢查而確定。
日本腦炎的預防通常由注射日本腦炎疫苗來達成，既安全又有效，其它方式包括避免蚊子咬。日本腦炎一旦感染，沒有特別的治療方法，只有支持性療法，在醫院躺著好好休息。半數從日本腦炎恢復的人都有後遺症。
日本腦炎多發生在東南亞或西太平洋，有30億人住在可能感染地區，每年有6萬8千左右有症狀的日本腦炎發生，約1萬7千死亡。通常大流行時受感染。
大約250位感染者中，有一位會有症狀，強烈的寒顫標誌著疾病的開始，發燒、頭痛、全身無力等會出現1～6天，然後進入急性感染症狀，如頸部僵硬、極度無力、半身不遂、抽筋、體溫升高至38℃～41 ℃，通常會出現智力下降。
兒童感染死亡率較高，母親也有可能通過垂直感染傳染新生兒，也可能產生終身缺陷，如耳聾、情緒倚賴、半身癱瘓等。日本腦炎病毒可活化腦部微膠細胞（Microglia）產生白血球介素1（interleukin-1，IL-1）與腫瘤壞死因子-α（tumor necrosis factor alpha，TNF-α），造成腦部的進一步傷害。微膠細胞還可能分泌神經毒素（neurotoxins）、刺激型神經傳導物質（excitatory neurotransmitters）、前列腺素（prostaglandin）、活性氧類（Reactive oxygen species）、活性氮物質（Reactive Nitrogen Species），以上種種都對神經系統產生傷害。◇
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