5月5日，日本當天感染中共病毒4,071人，其中重癥患者1,114人創下紀錄。距離東京奧運開幕不足3個月，每日染疫人數近5,000宗。尤其是東京和大阪地區確診人數急升。而在各地舉辦的奧運聖火傳遞過程中，發生中共病毒聚焦性感染。之前，日本首相菅義偉在記者會上表示，日本已進入第四波新冠（中共病毒）疫情感染浪潮。
據日本廣播協會NHK報道，4月27日、28日，在鹿兒島縣進行東京奧運會火炬接力時，有六名負責指揮交通的相關人員確定感染了中共新冠病毒，這是自東京奧運火炬傳遞過程中，一個縣首次發現多名相關人員聚集感染。
其實，早在4月17日，在四國香川縣負責聖火傳遞活動交通管製的警員，於18日出現病徵，隨後證實染上中共新冠肺炎，這是至3月25日奧運聖火在福島傳遞以來第一個感染案例。
第二例感染者是4月21-22日，在愛媛縣舉行的東京奧運會聖火接力賽時，也有警衛人員確診感染了中共病毒。
4月22日，日本內閣官房長官加籐勝信在記者會上表示，在印度發現的變種新冠病毒已在日本發現了5宗，這種病毒傳染性極強。
目前，在日本47個都道府縣均發現了英國、巴西等地的變異病毒。有日媒認為，變異病毒的大流行，對日本疫情防控增加了難度。
23日上午，日本經濟復興大臣西村康稔表示：除非我們採取更強有力措施，否則無法遏製疫情的傳播。要求東京、大阪、兵庫、京都四地，對提供酒精的餐館、卡拉OK場所及超過1,000平方米的商業設施都將被關閉；體育賽事不準觀眾入場；公交係統縮短營運時間。
同日，日本首相菅義偉也在記者會上表示，據統計，日本國內纍計的新冠肺炎患者已超54萬。我們將考慮防止疫情擴散等優先措施，根據緊急狀態做出響應。
他認爲，日本已進入第四波新冠疫情感染浪潮。隨後，宣布从4月25日至5月11日，東京、大阪、兵庫、京都四個都府縣，發佈自去年疫情以來第三次進入緊急狀態。
5月4日，大阪府吉村洋文知事表示，現在是黃金周長假，我認為很難解除感染，因為感染情況非常嚴重。所以打算在6日或7日召開大阪府對策總部會議，以正式決定是否要求政府延長緊急狀態。
出於防疫考慮，東京奧組委已正式宣佈，本屆奧運會不接待海外觀眾。但是，在接待境內觀眾方面，究竟是空場還是接待一半的觀眾，東京奧組委尚未決定。@
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