特區政府4月18日傍晚，短時間內發3份新聞稿，首篇指出中聯辦是根據《基本法》第22條成立，但其後推翻有關說法。4月21日林鄭會見傳媒時表示，近日港澳辦和中聯辦在基本法之下的角色和定位引起的爭議，對於政府上周發出的新聞公布引起的混亂，特區政府表示歉意。翻查特區政府《新聞公報》2017年林鄭回應議員的提問時說，「如果要在香港，中央單位不應干涉我們的事務」。
林鄭月娥同時承認，在不同的政府文件中對於基本法第 22 條關於中聯辦定位的陳述是「不完全清晰，也都未必一致」。
但林鄭認為，該事件不應影響或令人質疑政府對這個問題的清晰立場，亦不應有人借議題轉移視線，淡化引起這個討論問題的核心。她指責部分立法會議員，特別是郭榮鏗主持立法會內會所做的事，是「惡意拉布，罔顧公眾利益，影響立法會的運作。」
林鄭表示，現時的討論已偏離問題的核心，「惡意污衊中央機構在香港扮演的角色，一直以來，中聯辦一直以來確切履行其職責，並無干預香港特區依法自行管理的事務。」
林鄭還說，「因為中央已經賦予了香港高度的自治權。」但否認授權者沒有了自身監督的權力。
2000 年 1 月 21 日，政府曾在憲報刊登公告，列明中央政府在香港特區所設立的 3 個機構，其中就包括中聯辦在內。2007 年，政制事務局向立法會政制事務委員會遞交文件，提及中央政府在香港特區設立的機構，這些機構是根據《基本法》22 條設立，中聯辦也在名單之列。該文件同時引述 2000 年 1 月 21 日憲報，駐港機構也即中聯辦是受《基本法》22 條制約的。
林鄭曾說「中央的單位不應該干預我們的事務」
本報記者翻查香港特別行政區政府2017年7月5日《新聞公報》，特首林鄭月娥回應立法會議員楊岳橋提問：「請問特首，有沒有任何計劃為《基本法》二十二條立法，限制中央駐港機構角色，以防出現第二支管治隊伍？」
林鄭當時明確表明「中央的單位，不應該干預我們的事務」。
她說：「《基本法》22 條，亦都是說中央的單位，如果要在香港，就不應該干預我們的事務。我又看不到為甚麼由我們為中央去訂立一些法則或一些條件。」@
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